座席を一部固定席、一部フリーアドレスにすることはできますか？

はい、可能です。ユーザーごとに運用を変えることができます。
設定を変更するには、画面右上のユーザー名をクリックし、[個人設定]をクリックします。

「在席ステータス」の[変更]から座席タイプを選択し、[更新]をクリックします。座席タイプを"固定席"にしていただくと、座席を確保したまま帰宅状態にすることができます。